Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms