Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms