Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms