Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms