Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms