Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms