Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUPD1Q68J44 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms