Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms