Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms