Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC138749.1-201ENST00000567652 2472 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms