Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSD17B12Q53GQ0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSD17B12Q53GQ0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms