Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PDLIM3Q53GG5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PDLIM3Q53GG5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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