Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms