Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms