Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms