Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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