Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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