Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TRIP13Q15645 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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