Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms