Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SIX1Q15475 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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