Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SEC23BQ15437 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC23BQ15437 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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