Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRRQ15256 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRRQ15256 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRRQ15256 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRRQ15256 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PTPRRQ15256 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRRQ15256 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRRQ15256 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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