Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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COL19A1Q14993 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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COL19A1Q14993 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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COL19A1Q14993 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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COL19A1Q14993 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms