Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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CHD4Q14839 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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CHD4Q14839 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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CHD4Q14839 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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