Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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