Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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