Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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