Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms