Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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