Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms