Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL390835.1-201ENST00000413941 901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 AC044839.1-208ENST00000634902 917 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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