Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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