Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms