Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms