Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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KCNMA1Q12791 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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KCNMA1Q12791 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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KCNMA1Q12791 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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KCNMA1Q12791 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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KCNMA1Q12791 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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KCNMA1Q12791 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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KCNMA1Q12791 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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