Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms