Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP1B1Q10567 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms