Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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