Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms