Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms