Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms