Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms