Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms