Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms