Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAE1P78406 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAE1P78406 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms