Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HBBP68871 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms