Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P62684 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms