Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFM1P61960 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms