Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS3AP61247 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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