Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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